تأسست المكتبة عام 1991 ، مع بداية إنشاء الجامعة واستطاعت خلال مدة قصيرة أن تحقق نموا وتطورا سريعين ، ويعتبر مبنى مكتبة جامعة فيلادلفيا بعد انتقالها إلى موقعها الجديد معلما حضارياً بارزا من معالم الجامعة ، وقد تم افتتاح مبنى المكتبة الحديثة رسميا في الأول من تشرين الأول لعام 1998 .

فقد تم بناء مبنى المكتبة الدائم وفق أحدث التصاميم المعمارية ، وجاء هذا التصميم مستوحى من الطراز المعماري الإسلامي ، ومنسجما مع بقية مباني الجامعة ومرافقها. وهو يتوسط مباني الجامعة بمثابة القلب النابض لها ، كما تتوافر في البناء الرحابة والسعة ، والتهوية الجيدة ، والإنارة المناسبة إلى جانب التدفئة المركزية والموزعة توزيعا جيدا في جميع مرافق المكتبة . ويتكون المبنى من ثلاثة طوابق ، بمساحة إجمالية قدرها ( 4600 ) متر مربع ، وبكلفة إجمالية بلغت حوالي مليون دينار وقد تمت الموافقة على بناء طابق رابع بمساحة 2200 متر مربع في عام 2002 حتى تفي الجامعة بمتطلبات شروط الاعتماد لستة آلاف طالب .

• الطابق الأرضي : ويتألف من المدخل الرئيسي للمكتبة وخزانات العرض للكتب الحديثة والنادرة واللوحات الاعلانية ، كما تزينه لوحة جدارية لخارطة فلسطين القديمة الموجودة في كنيسة " نبو"
• الطابق الأول : ويضم قاعات الكتب والمطالعة التالية :
  • قاعة الكتب العربية والمطالعة تتسع لـ (290 ) قارئ وباحث .
  • قاعة الكتب الأجنبية والمطالعة وتتسع لـ (378) قارئ وباحث .
  • وحدة الإعارة والإرجاع ، حيث تتم فيه عملية تسجيل الكتب عند الإعارة وشطبها عند إرجاعها .
  • قسم التزويد : وهو القسم الذي يقوم بتغذية المكتبة بالكتب والمصادر المختلفة .
  • قسم تنظيم المعرفة : وهو القسم الذي يقوم بعملية فهرسة الكتب وتصنيفها وفق القواعد والمعايير الدولية ، ومعالجة البيانات آلياً باستخدام حزمة برمجيات CDS/ISIS .
  • المختبر التعليمي : حيث يتم فيها عرض الأشرطة والأفلام التعليمية واسترجاع المعلومات الالكترونية وتضم ثمانية أجهزة حاسوب حديثة لاسترجاع البيانات من الفهارس الآلية .
  • ردهة الفهارس الآلية: وهي تحتوي على ثمانية أجهزة حاسوب الي تستخدم من قبل الطلبة حيث يقومون بالتعرف على الكتب التي تتناول عنوانا محددا أو تتعلق بمؤلف او هيئة محددة او تبحث في موضوع معين، وهي البديل الإلكتروني لفهارس البطاقات التقليدية.
• الطابق الثاني : ويضم
  • قاعة المراجع العربية والأجنبية وقاعة للمطالعة تتسع لـ (80) باحث وقارئ .
  • قاعة الدوريات الجارية ومجموعات الدوريات السابقة وقاعة المطالعة الملحقة بها وتتسع لـ (265) باحث وقارئ .
  • المكتبة الإلكترونية وهي مزودة بأجهزة الحاسوب وتتسع ل (16)شخصا .
  • خلوات البحث لأعضاء هيئة التدريس لإجراء البحوث والدراسات وهي موزعة على قاعات المطالعة ويبلغ عددها ثلاثة وثمانون خلوة .
  • مكاتب إدارة المكتبة : وتضم مكتب مدير عام المكتبة ، ومكاتب أعضاء الهيئة التدريسية لقسم المكتبات والمعلومات والوحدة الإدارية .
• الطابق الثالث : ويضم المصلى الذي يتسع لخمسين شخصاً